Contrato predoctoral en bioinformática - ómicas para estudiar comorbilidades en psiquiatría

Date limit
18-09-2024
Institution
Universitat de València (UV)

 

Proyecto: «Landscape of Cancer multimorbidities in people with central nervous system disorder: aligning electronic health records, preclinical research and omics data for translational science (Sorolla Projet). CPI-24-380». Programa Prometeo para grupos de investigación de Excelencia de la Conselleria de Innovación, Universidades, Ciencia y Sociedad Digital (actualmente: Conselleria de Educación, Universidades, y Empleo) (CIPROM/2022/058), ayudas convocadas por Resolución de 6 de octubre de 2022.

 

Oferta pública de un puesto de trabajo de investigador/a en formación.

1. Condiciones generales del puesto de trabajo ofertado

1.1. Denominación y clasificación del puesto de trabajo:

Investigadora/investigador en formación.

Grupo: A.

Subgrupo: A1.

1.2. Jornada de trabajo: 35 horas semanales.

1.3. Dotación de la ayuda. Según lo establecido en el apartado Primero 6.a) 1. del anexo XI de la Resolución de 6 de octubre, de la Conselleria de Innovación, Universidades, Ciencia y Sociedad Digital (actualmente: Conselleria de Educación, Universidades, y Empleo), por la que se convocan para el ejercicio 2023, subvenciones del Programa para la promoción de la investigación científica, el desarrollo tecnológico y la innovación en la Comunitat Valenciana (DOGV 9449 / 14.10.2022).

1.4. Funciones y tareas a desarrollar:

  • Análisis de estudios de Genome Wide Association Studies, cálculo de correlaciones genéticas y estudios de aleatorización mendeliana.
  • Análisis de datos transcriptómicos basados en arrays de expresión y RNAseq.
  • Meta-análisis de expresión diferencial.
  • Cálculo de asociaciones transcriptómicas entre parejas de enfermedades.
  • Análisis de datos transcriptómicos basados en single-cell RNAseq.
  • Uso de pipelines basados en Scanpy y Seurat.
  • Anotación de tipos celulares.
  • Análisis de expresión diferencial, redes de co-expresión y actividad de regulones.
  • Manejo de repositorios de fármacos y líneas celulares como Connectivity Map y LINCS L1000.
  • Desarrollo de una enciclopedia online que permita el acceso por parte de la comunidad de los resultados obtenidos en el proyecto.

1.5. Objeto y periodo: estudio de la comorbilidad entre enfermedades del sistema nervioso central y el cáncer desde una perspectiva epidemiológica y molecular.

El contrato estará determinado por la duración del proyecto y la disponibilidad presupuestaria.

1.6. Requisitos:

1.6.1. Titulación: Grado en Áreas de Ciencias y/o Ciencias de la Salud, o titulación equivalente.

1.6.2. Estar admitido/a en un programa de doctorado en la Universitat de València en el momento de su contratación.

 

2. Baremo

2. 1. Méritos preferentes:

2.1.1. Nota media del expediente académico de los estudios de licenciatura, arquitectura, ingeniería, grado, diplomatura, arquitectura técnica o ingeniería técnica, en base 10, calculada, de acuerdo con Real decreto 1125/2003, de 5 de septiembre, por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en las titulaciones con carácter oficial, sobre la totalidad de los créditos evaluados del 1º y del 2º ciclo.

2.1.2. Beca de colaboración del Ministerio de Educación: 0,05 puntos.

2.1.3. Premio extraordinario de diplomatura, licenciatura, grado o máster: por la obtención de cualquiera de estos premios se asignará un único valor de 0,25 puntos.

2.1.4. Publicaciones científicas relacionadas con el objeto del contrato (hasta un máximo de 1,70 puntos):

2.1.4.1. Por cada publicación en una revista que aparezca en el Citation Index, o, en el caso de las Ciencias Sociales y Humanidades, en una revista considerada como equivalente por la comisión de investigación: 0,5 puntos.

2.1.4.2. Por cada publicación en revistas científicas no relacionadas en los listados mencionados en el punto anterior: 0,25 puntos.

2.1.4.3. Por cada participación en congresos u otras reuniones científicas, con carácter nacional o internacional, mediante comunicación, ponencia o póster: 0,05 puntos.

2.2. Otros méritos preferentes relacionados con el objeto del contrato (hasta un máximo de 3 puntos).

  • Máster en Bioinformática, o en Biología Computacional, o en Ciencia de Datos.
  • Manejo de los lenguajes de programación Python, R y bash.
  • Experiencia en pipelines de análisis de datos transcriptómicos incluyendo: arrays de expresión, RNAseq, y single-cell RNAseq.
  • Experiencia en el manejo de datos derivados de estudios de GWAS, análisis de correlaciones genéticas y aleatorización mendeliana.
  • Experiencia en la realización de revisiones sistemáticas y metaanálisis.
  • Experiencia previa en métodos básicos de laboratorio incluyendo cultivos celulares, microscopía y técnicas básicas en biología molecular.
  • Buenas dotes de comunicación científica.
  • Experiencia en métodos de visualización de datos mediante el empleo del paquete de R Shiny.

La comisión podrá acordar la realización de una entrevista con el objeto de concretar mejor la valoración de los méritos preferentes.

 

3. Comisión evaluadora titular

Presidente: José Tomas Real Collado, profesor del Departament de Medicina.

Vocal 1: Rafael Tabares Seisdedos, profesor del Departament de Medicina.

Vocal 2: Julián Carretero Asunción, profesor del Departament de Fisiologia.

Vocal 3: Rosa Noguera Salva, profesora del Departament de Patologia.

Secretaria: Gloria Vta. Segarra Irles, profesora del Departament de Fisiologia.

 

4. Comisión evaluadora suplente

Presidenta: Maria José Forner Giner, profesora del Departament de Medicina.

Vocal 1: Maria Pilar Sierra San Miguel, profesora del Departament de Medicina.

Vocal 2: Manuel Mata Roig, profesor del Departament de Patologia.

Vocal 3: Sergio Martínez Hervas, profesor del Departament de Medicina.

Secretaria: María Peñarrocha Diago, profesora del Departament de Estomatologia.

Para las comunicaciones y cualquier problema que pueda surgir, la comisión evaluadora tendrá la sede en el Departament de Medicina de la Facultat de Medicina i Odontologia, de la Universitat de València

 

Toda la información de la convocatoria: https://dogv.gva.es/datos/2024/09/04/pdf/dogv_2024_9929_es.pdf

Información original: https://www.uv.es/uvweb/servicio-recursos-humanos-pas/es/personal-investigacion/convocatorias/convocatorias/cpi-24-380-1285931577510/ConvPASInves.html?id=1286396483737