El Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) convoca un proceso selectivo para la contratación de DOS PUESTOS, mediante contrato de obra o servicio, con cargo al proyecto “Vigilancia genómica y epidemiológica de la infección provocada por SARS-CoV-2: Plataforma web”.
Descripción detallada de las funciones:
- Desarrollo e implementación de un portal web que facilite el acceso al repositorio de genomas virales recogidos para la vigilancia genómica y epidemiológica de la infección provocada por SARS-CoV-2, y que incluya herramientas de análisis, explotación y visualización de los datos.
- Elaboración de protocolos para compartir los datos entre la red de laboratorios que componen el programa de vigilancia. Desarrollo de las herramientas de análisis (pipelines) para organizar las secuencias genómicas de SARS-CoV-2 en el formato ajustado a las bases de datos de referencia para poder integrarlos en las mismas. Identificación de criterios de calidad y evaluación las secuencias genómicas virales
- Integración de la información genómica y epidemiológica. Colaboración en el desarrollo de un repositorio de genomas virales que incluyan los datos epidemiológicos
- Adaptación de estos desarrollos a la plataforma HPC del ISCIII.
- Las funciones descritas se desarrollarán en lenguajes de programación python, bash, SQL, AWK, Java, HTML, Django framework, R; los flujos de análisis se desarrollarán en Nextflow y se generarán containers para su fácil instalación. Todo ello en un entorno de computación de alto rendimiento, Sun Grid Engine (SGE)
Tiempo de contrato: esta contratación es para una jornada laboral a tiempo completo y tendrá una duración estimada de 12 meses, prorrogable.
Plazo de presentación de solicitudes: 2 al 13 de agosto, 2021
Las personas interesadas pueden enviar su cv además de a la convocatoria (en las condiciones en las que lo exige), a bioinformatica@isciii.es
Esta convocatoria y todos los actos que se deriven de ella se publicarán, al menos, en la página Web del Instituto de Salud Carlos III, www.isciii.es y en el Punto de Acceso General www.administracion.gob.es
Original source: https://www.isciii.es/Trabajar/Empleo/Paginas/Empleo/SGAFIPY-375-21-TS-1-y-2.aspx