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TransBioNet: A distributed bottom-up effort to organise bioinformatics activities around the Spanish National Health System

 

TransBioNet is the Translational Bioinformatics Network impulsed and coordinated by the Spanish National Bioinformatics Institute (INB) as a reference network of 43+ bioinformatics support units working at health care settings including Health Research Institutes (IIS) certified by the Carlos III Health Institute (ISCIII), and bioinformatics core facilities from biomedical research institutions. TransBioNet is an Excellence Thematic Network (Red de Excelencia Temática) recognised by the Spanish Ministry of Science and Innovation.

The main purpose of TransBioNet is to create an expert forum where bioinformaticians working in healthcare can share best practices and working experiences, have early access to the latest technological developments and guidelines by international organizations and initiatives such as ELIXIR (European Life Science Infrastructure for Biological Information) and GA4GH (Global Alliance for Genomics and Health), and benefit from access to the computational infrastructures provided by the INB and ELIXIR.

The commitment of INB includes logistic and economic support for TransBioNet activities, e.g. training, including the periodic workshops held at different sites. Given the highly collaborative nature of TransBioNet, it is open to bioinformatics units working in healthcare settings and/or bioinformatics core facilities at biomedical research institutions.

Currently, TransBioNet is organising its activities around three working groups and a task force to answer the identified needs and opportunities in the following areas: Standards and Benchmarking, Sustainability models, Training, and a report about the translational bioinformatics landscape in Spain.

 

Acronym TransBioNet member
IGTP Instituto de Investigación En Ciencias de la Salud Germans Trias i Pujol
VHIR Instituto de Investigación Hospital Universitari Vall d’Hebron
IRYCIS Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria
i+12 Instituto de Investigación Sanitaria 12 De Octubre
IIS LA PRINCESA Instituto de Investigación Sanitaria Hospital Universitario de la Princesa
IMIB Instituto Murciano de Investigación Biosanitaria Pascual Parrilla
IIS BIODONOSTIA Instituto de Investigación Sanitaria Biodonostia
IBIS IBIS (Instituto de Biomedicina de Sevilla)
IdiPAZ Instituto de Investigación Sanitaria Hospital la Paz
CRG Centre for Genomic Regulation 
IRB Barcelona Institute for Research in Biomedicine Barcelona
ISCIII Instituto de Salud Carlos III
IACS Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud
IIS Aragón Instituto de Investigación Sanitaria Aragón
IMIBIC Instituto Maimónides de Investigación Biomédica de Córdoba
IiSGM Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón
IDIBELL Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge
ISPA Instituto de Investigación de Sanitaria del Principado de Asturias
IRB Lleida Instituto de Investigación Biomédica de Lérida
INCLIVA Instituto de Investigación Sanitaria Fundación para la Investigación del Hospital Clínico de Valencia
IIS FJD Instituto de Investigación Sanitaria Fundación Jiménez Díaz
IMIM Instituto Hospital del Mar de Investigaciones Medicas
IdISSC Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Clínico San Carlos
CIPF Centro de Investigación Príncipe Felipe
IBIMA Plataforma Bionand (Instituto de Investigación Biomédica de Málaga y Plataforma en Nanomedicina)
IdiSNA Instituto de Investigación Sanitaria de Navarra
GENYO Centre for Genomics and Oncological Research
IMDEA Instituto Madrileño de Estudios Avanzados
IDIS Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago de Compostela
IRSJD Institut de Recerca Sant Joan de Déu
IDIBAPS Instituto de Investigaciones Biomédicas August Pi y Sunyer
IBSAL Instituto de Investigación Biómedica de Salamanca
IdISBa Instituto de Investigación Sanitaria Illes Balears
IDIPHIM IIS Instituto de Investigación Sanitaria Puerta de Hierro
ibs.GRANADA Instituto de Investiación Biosanitaria de Granada
IDIVAL Instituto de Investigación Marqués de Valdecilla
CNIC Centro Nacional de Investigaciones Cardivasculares
IIB SANT PAU Instituto de Investigación Biomédica Sant Pau
IIS Biobizkaia Instituto de Investigación Sanitaria Biocruces Bizkaia
I3PT Instituto de Investigación e Innovación Parc Taulí
ISABIAL Instituto de Investigación Sanitaria y Biomédica de Alicante
IIS La Fe Fundación para la Investigación del Hospital Universitario La Fe
CNAG Centro Nacional de Análisis Genómico